O Professor João Mota iniciou a sua carreira de treinador no FC Foz.
Serviu, de forma exemplar, o FC Porto, no papel de preparador físico. Antes de regressar aos “dragões”, passou também pelo Feirense, que na altura militava na primeira divisão, e também pelo Leixões, desta feita nas camadas jovens.
Além do futebol, também se dedicou à vida política, enquanto deputado do PSD.